La disbiosis es la alteración (cambios en la composición, en el número, en la organización…), de la microbiota, es decir, del conjunto de microorganismos que de manera normal conviven en nuestro cuerpo. La disbiosis puede ser causada por la colonización por microorganismos patógenos, por el uso masivo de antibióticos, por los mecanismos de higiene, por una dieta inadecuada, por diferentes enfermedades… La disbiosis puede ser intestinal, cutánea… en función de la microbiota que esté alterada.
El término contrario sería la eubiosis.